Имущественный налоговый вычет, предусмотренный подпунктом 2 пункта 1 статьи 220 НК РФ, может быть предоставлен налогоплательщику - физическому лицу при его обращении к работодателю (налоговому агенту), при условии подтверждения права на такой вычет (п.3 ст.220 НК РФ).

Подтверждение выдается налоговым органом по месту жительства налогоплательщика.

С учетом положений статьи 20 ТК РФ и пункта 1 статьи 226 НК РФ к работодателям следует относить головные российские организации. Обособленные подразделения таких организаций ни работодателями, ни налоговыми агентами не являются.

Поэтому подтверждение адресуется самой российской организации и может быть использовано в течение соответствующего налогового периода в целях уменьшения налоговой базы сотрудника независимо от конкретного места его занятости: как в головной компании, так и в любом из обособленных подразделений (письмо ФНС России от 30.10.2008 № 3-5-04/657@).

Таким образом, при переходе сотрудника из одного обособленного подразделения в другое вы можете продолжать предоставлять ему имущественный вычет.